眼部扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，常见于儿童和青少年，尤其是在面部和颈部。眼部扁平疣一般不需要紧急处理，但如果影响美观或者引发患者不适，可以考虑以下几种去除方法：

1. 自然消退：多数扁平疣会在数月至两年内自然消退，无需特殊治疗。

2. 局部药物治疗：可用含有5%水杨酸、或3.5%过氧化苯甲酰等处方药膏，每日涂抹，帮助去除疣体。但这需要遵循医生的指导和建议，因为不当使用可能导致皮肤刺激或色素沉着。

3. 冷冻疗法（液氮冷冻）：医生会使用液氮将扁平疣冷冻，疣体会在几周内脱落。这是一种常见的治疗方式，但可能会留下淡色疤痕。

4. 手术切除：对于较大、难以去除或者多次复发的扁平疣，可能需要医生进行手术切除。这种方法效果较好，但可能会留下微小疤痕。

5. 光动力疗法：这是一种新兴的治疗方法，医生会使用特殊光线和药物结合，破坏病毒和损害疣体。这种方法也可能会有副作用，但效果良好且治愈率较高。

在处理眼部扁平疣时，请务必遵循医生的指导，选择适合自己的治疗方式。因为眼部皮肤较为敏感，避免自行操作，以防感染或损伤到正常组织。