复杂性肛瘘是指内口多，外口也多，管道纵横交错，不易彻底治愈的肛瘘。治疗复杂性肛瘘的方法主要有以下几种：

1. 手术治疗：这是常用的方法，尤其是切开挂线术（Aziz手术）和肛瘘切除术。手术时会先找到内口，逐个切开并用橡皮筋或金属线悬挂，使管道闭合，阻止感染往肛门内蔓延，然后从外口排出脓液。

2. 微创治疗：如肛瘘PLD（Prolene Ligation Device）治疗，通过注入硬化剂使瘘管闭合，减少手术创伤，恢复快。

3. 电凝、电切或激光治疗：适用于一些位置特殊或难以手术的肛瘘。

4. 局部药物治疗：对于一些病变轻、炎症不严重的简单肛瘘，可以试用抗生素软膏、口服抗生素等药物，但治愈率低，容易复发。

5. 中医治疗：可用中药内服或外用，如清热解毒、消肿止痛的药物，对人体损伤相对较小，但治愈率和效果相对较慢。

复杂的肛瘘治疗时需根据患者具体情况，由医生选择最适合的治疗方案。术后应注意休息，避免便秘和过度用力，遵医嘱进行伤口护理，定期复查，防止感染和复发。