后半夜腰疼可能有多种原因：

1. 肾病：肾结石、肾盂肾炎或肾病可能导致腰部疼痛，尤其是在睡眠时因体位改变而加重。

2. 腰肌劳损或扭伤：长时间坐着或站立，缺乏运动，可能导致腰肌劳损，特别是在后半夜你放松后，疼痛可能会更明显。

3. 骨骼问题：如脊椎疾病如椎间盘突出、腰椎退行性病变等，也可能引起腰疼。

4. 睡眠姿势：不正确的睡眠姿势，如长时间侧卧可能会压到腰部，引发疼痛。

5. 内脏疾病：如胃肠道疾病（如胃炎）也可能反射到腰部产生疼痛。

6. 消化系统问题：例如肾功能不全、肾积水等情况，消化液或尿液反流到肾周围也可能引起腰痛。

如果腰疼持续或加重，建议及时就医，进行相关检查以确定病因进行治疗。同时，保持良好的生活习惯，如合理运动、坐姿正确、睡眠时选择合适的枕头和床垫等也是预防腰疼的重要措施。