早晨起床腰疼可能有多种原因，以下是一些常见的解释：

1. 睡眠姿势不当：翻身睡觉时，如果腰部没有得到适当的支撑，可能会导致腰疼。特别是软床垫或过于柔软的枕头可能导致脊椎扭曲。

2. 肌肉劳损：如果你前一天做了较多的腰部活动或者长时间保持一个姿势（如长时间坐着或站立），可能会造成肌肉疲劳和疼痛。

3. 椎间盘问题：如果你有关节问题或者椎间盘突出（如腰椎间盘突出症），可能会在长时间休息后感到疼痛。

4. 长期坐姿不良：长期久坐，特别是在电脑前工作，可能会引发下腰痛。

5. 缺乏运动：缺乏运动，肌肉萎缩，腰部柔韧度下降，也可能在早晨起来时感到疼痛。

6. 荷尔蒙变化：在女性中，经期或绝经期可能会出现短期的腰痛。

7. 肾结石或肾病：腰部疼痛也可能与其他疾病有关，如肾结石，虽然这种情况可能伴有其他症状，如尿频、尿痛等。

如果腰疼持续不减或者伴有其他症状，如发热、麻木、排尿困难等，建议及时就医，以排除更严重的问题。平时应注意保持良好的坐姿和睡姿，适当活动，加强核心肌群训练。