牙根变黑可能是由于以下原因：

1. 牙齿内部有龋坏或根尖周炎：牙齿内部的细菌感染可能导致牙本质（牙齿的硬组织）变色，如果病情长时间没有得到治疗，可能会影响到牙根。
2. 色素沉着：食物、饮料或某些药物可能导致牙齿颜色变化。
3. 偏方治疗不当：有些使用不当的美白产品或治疗方法可能导致牙根变黑。

处理方法：

1. 尽早就医：如果是因为龋坏或牙周病，应尽快到牙科诊所进行检查和治疗。如果感染严重，可能需要做根管治疗或牙齿拔除。

2. 专业清洁：定期进行专业的牙齿清洁（如洗牙等），去除牙齿表面和牙龈边缘的牙石和菌斑。

3. 色素去除：对于因色素沉着引起的牙根变黑，可以通过专业的美白技术进行治疗，但应先咨询牙医以确定是否适合。

4. 注意口腔卫生：定期刷牙，使用牙线或冲牙器清洁牙缝，避免吃色素重的食物和饮料。

5. 避免不当治疗：避免使用可能会损伤牙齿的方法进行美白或治疗。

总之，牙根变黑是一个严肃的问题，需要专业的牙医评估并制定治疗方案。切勿自行处理，以免病情加重。