1.虽然手足口病患者大多数可以顺利康复，但少数患者可出现并发症：

(1)神经系统并发：神经系统症状包括嗜睡、厌食、呕吐、头痛、精神差、抽搐、意识障碍、昏迷、脑膜脑炎。重症病例早期往往额头、颈部、躯干可见皮疹，接着向四肢发展，最后手足疹消失。重症病例的皮疹通常很少，甚至没有皮疹，发热较高。可能合并口炎，表现为口痛、拒食、流涎、手足黏膜疱疹或溃疡，最长可达2周。

(2)循环系统并发：循环系统症状包括血压下降、心慌、憋气、面色苍白、发灰、唇舌紫绀、心率增快等。若合并心脏炎，表现为心悸、胸闷、固定听诊区可闻及杂音及早搏等。

(3)呼吸系统并发：呼吸系统症状如喉咙痛、声音嘶哑、喘气、呼吸困难、口唇青紫等。严重时可出现喉头水肿，并发喉炎，临床表现常有发热昏迷、声音嘶哑或失声、吸气性呼吸困难，甚至呼吸衰竭。

(4)其他:病情加重时可能出现肺水肿、脑炎、脑膜炎、肠道感染或败血症等，甚至造成死亡。

2.少数病例可出现无菌性脑膜炎等神经系统后遗症。

3.极少数暴发型病例病情凶险，短时间内可因脑水肿、脑疝、循环衰竭、多脏器功能衰竭等导致死亡。病毒侵犯神经系统的严重后果可以导致孩子的智力发育障碍、运动障碍。轻度后遗症如肌肉萎缩等，严重后遗症如癫痫、脑瘫、语言障碍等，往往持续到成年期。因此，儿童手足口病的早期识别和及时处理至关重要。