肾结石是一种晶体物质（如钙、草酸、尿酸、磷酸盐等）在肾脏内形成固体块状物（即结石）的过程，多数情况下，结石位于肾脏的泌尿系统中。当肾结石移动或阻塞尿液流动时，可能会引起一系列症状，其中包括腰痛。

肾结石引起腰痛的原因主要是：

1. 石头刺激：结石在肾脏内移动或停留在肾盂、输尿管时，会对周围组织产生刺激，尤其是当结石卡住或摩擦尿路壁时，疼痛感会加剧。

2. 尿液梗阻：结石阻塞了尿液的流动，加重肾脏和输尿管的负担，导致尿液滞留和肾积水，引发持续的剧烈腰痛。

3. 炎症：结石下移过程中可能会引起尿路黏膜感染或炎症，这种炎症也会引起腰痛。

4. 神经受压：结石较大或者位于输尿管开口附近时，可能会压迫到尿路周围的神经，引起疼痛。

因此，当出现腰痛，尤其是在特定的体位（如半夜或早晨起床时）疼痛加重时，建议及时就诊，以便进行相关检查以确定是否存在肾结石。