干呕在三个月大的宝宝中很常见，可能是多种原因引起的。以下是一些可能导致干呕的原因：

1. 胃食管反流（GERD）：这是一种消化系统问题，可能导致宝宝在吃奶或进食时出现干呕。GERD的症状包括干呕、吐奶、呕吐、咳嗽和呼吸困难。如果怀疑宝宝患有GERD，建议咨询医生进行进一步评估和治疗。

2. 食道括约肌松弛：在宝宝出生后，食道括约肌可能还没有完全发育成熟，这可能导致食物或液体在食道中反流。这种情况通常在宝宝出生后的几周内自行消失。

3. 胃胀气：宝宝在进食时可能会吞下过多的空气，导致胃胀气。胃胀气可能会引起宝宝干呕。

4. 呼吸道感染：呼吸道感染可能导致宝宝出现干呕、咳嗽、发热等症状。如果怀疑宝宝患有呼吸道感染，建议咨询医生进行进一步评估和治疗。

5. 消化问题：某些消化问题，如乳糖不耐受或食物过敏，也可能导致宝宝出现干呕。如果怀疑宝宝患有消化问题，建议咨询医生进行进一步评估和治疗。

如果你的宝宝干呕的情况持续存在，建议你咨询儿科医生进行进一步评估和治疗。医生可能会建议进行一些检查，如胃镜或食道括约肌松弛测试，以确定具体的原因。