婴儿做核磁共振（MRI）通常是安全的，它不会对大脑造成直接的危害。MRI是一种无创的医学成像技术，利用强大的磁场和无害的无线电波来生成身体内部结构的图像，而不使用X射线或者辐射。对于新生儿和婴儿，医生会在充分评估医疗需要后权衡可能导致的惊吓或不适，通常会尽可能使用最小剂量的强磁场和快速扫描的方式来减少不适。

然而，因为婴儿的神经系统还在发育，有时候可能会因为移位或不适而哭闹，这可能导致短暂的脑部血流变化。但这种变化通常是短暂的，且MRI的成像质量能帮助医生做出更准确的诊断，这对婴儿的潜在益处大于风险。

在为婴儿安排MRI检查时，务必遵循专业的医疗建议，并确保在医疗人员的指导下进行，以最大程度地保障孩子的安全。