南京有很多专业医院可以治疗尖锐湿疣，以下是几家在该领域有较好口碑的医院供您参考：

1. 南京市第二医院皮肤性病科：该医院皮肤性病科在尖锐湿疣的治疗方面颇具实力，设备和技术较为先进。

2. 南京市鼓楼医院皮肤科：作为三甲医院，鼓楼医院的皮肤科也是治疗尖锐湿疣的不错选择，医生经验丰富。

3. 江苏省人民医院皮肤科：该医院是江苏省的大型综合医院，治疗尖锐湿疣的技术水平较高。

4. 南京市妇幼保健院皮肤科：如果涉及到女性患者，南京市妇幼保健院可能是一个好的选择，他们有专门为女性病人提供服务的皮肤科。

在选择医院时，建议您查看医院的专家团队、设备和技术、患者评价等信息，同时最好是提前电话咨询或在线挂号，了解具体情况。同时，请注意，尖锐湿疣的治疗需要在专业医生的指导下进行，不要自行购买药物或使用不安全的方法。