会厌囊肿手术是一种常见的手术治疗方法，主要用于治疗会厌囊肿。手术本身通常不会造成明显的后遗症，但如果手术操作不当或者术后护理不当，可能会出现一些并发症。

常见的后遗症包括：

1. 声音嘶哑：手术可能会损伤喉部神经，导致声音嘶哑。这种情况通常可以通过手术修复或者康复训练来缓解。

2. 吞咽困难：手术可能会损伤食道，导致吞咽困难。这种情况通常可以通过手术修复或者康复训练来缓解。

3. 感染：手术可能会导致感染，特别是在手术操作不当或者术后护理不当的情况下。感染可能会导致发热、喉咙疼痛等症状，需要及时治疗。

4. 手术切口疼痛：手术切口可能会出现疼痛，这种情况通常可以通过口服止痛药或者局部麻醉来缓解。

因此，在会厌囊肿手术后，患者需要密切关注自己的症状，如果出现任何不适，应该及时就医。同时，术后的康复训练和护理也是非常重要的，可以帮助患者尽快恢复健康。