13岁的男孩脸上长痘痘，医学上通常称为青春痘或者粉刺，这是青春期常见的一种皮肤问题。主要由于以下几个原因：

1. 雌激素水平下降：青春期男孩体内的雄激素水平逐渐升高，而雌激素水平下降，导致皮脂腺分泌过多，堵塞毛囊，形成粉刺。

2. 皮脂腺过度活跃：青春期时，皮肤油脂分泌旺盛，尤其是脸部，过多的油脂容易滋生细菌，引发炎症。

3. 毛囊角化异常：毛囊口周围角质层增厚，使得皮脂不能正常排出，形成痘痘。

4. 细菌感染：皮肤上的痤疮丙酸杆菌等细菌会导致毛囊发炎，形成红肿的痘痘。

5. 压力和生活习惯：精神压力大，睡眠不足，饮食不均衡等也可能影响皮肤状况。

如果痘痘情况严重，建议就医寻求专业的皮肤科医生帮助，他们可能会针对性地给出治疗建议，如使用药物、改善生活习惯等。同时，保持良好的卫生习惯，如定期清洁面部，避免手部频繁接触脸部，也是预防痘痘的有效方法。