怀孕初期三个月内，肚子疼可能有多种原因，但并不是所有疼痛都是正常的。以下是一些可能的原因：

1. 子宫扩张：随着胎儿的发育，子宫扩大，可能会引起轻度的疼痛或不适。
2. 子宫肌肉拉伸：子宫周围的肌肉为了支撑胎儿，可能会有轻微的疼感。
3. 绒毛膜异位：有时怀双胞胎或多胞胎，其中一个胎盘可能附着在子宫壁外，可能会引起疼痛。
4. 卵巢囊肿：怀孕早期，卵巢可能会形成一些小囊肿，也可能引起轻微的疼痛。
5. 激素变化：怀孕激素水平升高可能导致腹部不适。
6. 便秘或肠胃问题：孕期肠胃系统的改变也可能会导致疼痛。
7. 先兆流产：如果是剧烈疼痛且伴随着出血，可能是先兆流产的症状，应立即就医。

然而，任何孕妇出现肚子疼，尤其是在前三个月，都应该及时咨询医生，以确保母婴安全。尤其疼痛持续或加重，应尽快就医。