新生儿耳朵畸形（也称为耳部结构异常或发育不良）的原因可能有多种，这些因素包括：

1. 遗传因素：父母中的一方或双方如果存在耳部畸形，孩子可能会有遗传风险。

2. 染色体异常：某些类型的染色体异常，如唐氏综合征（Down syndrome），就与耳部结构问题有关。

3. 宫内环境：孕期母亲如果接触了某些药物、酒精或有害物质，可能会对胎儿的耳朵发育造成影响。

4. 母体疾病：某些妊娠期并发症，如妊娠期糖尿病、妊娠高血压，也可能增加新生儿耳部畸形的风险。

5. 胎儿期耳部感染或炎症：在母体内，如果孕妇有耳部感染或炎症，可能通过胎盘传递给胎儿，影响耳部发育。

6. 突发性发育问题：有时，婴儿出生时耳朵的畸形可能是由于胎儿发育过程中的突发性问题导致的。

对于具体的原因，应由医生根据详细检查和遗传咨询来确定。如果发现新生儿有耳部畸形，应及时咨询专业医生，以便提供适当的治疗和关注。