肩膀疼痛可能由多种原因引起，尤其是在睡觉时。以下是一些可能的原因：

1. 坐姿或睡姿不良：如果你长时间保持不良的坐姿或者枕头不合适，可能会导致肩膀疼痛。

2. 肩部过度使用：如果你经常做重物搬运或者进行需要肩膀活动的运动，肌肉可能疲劳并引发疼痛。

3. 肩周炎或肩袖损伤：这些是常见的肩部疼痛原因，尤其是长期反复的劳损或者运动损伤。

4. 颈椎问题：颈椎病的患者可能会感到肩膀疼痛，因为颈椎和肩部有着神经联系。

5. 睡眠姿势不当：比如侧卧时如果肩膀受压，可能会导致疼痛。

如果你的肩膀疼痛持续或者影响到日常生活，建议去医院就诊，医生可能会进行详细的检查以确定疼痛的原因，并给出相应的治疗建议。在等待就医期间，可以试着调整睡姿，使用适合自己的枕头，做一些肩部放松运动，避免过度劳累。