小便时肚子疼可能是由几种原因引起的：

1. 尿路感染：这是最常见的原因，特别是对于女性。细菌感染可能会引起膀胱炎或尿道炎，导致尿频、尿急、尿痛和腹部不适。

2. 肾结石：如果疼痛放射到腰部或下部背部，并伴有尿频和血尿，可能是肾结石导致的。结石阻塞尿道可能导致腹部不适。

3. 泌尿系统疾病：如膀胱炎、肾炎、尿道狭窄、前列腺炎等也可能导致小便时肚子疼。

4. 膀胱炎或尿道炎：这些炎症也可能导致尿痛，尤其是在排尿时或之后。

5. 其他原因：便秘、消化不良、过度用力排尿、妇科疾病（如宫颈炎、附件炎）等也可能引起类似症状。

如果您的症状持续存在，建议及时就医检查，以确定具体原因并接受相应治疗。同时，保持良好的生活习惯，如多喝水、保持个人卫生，可以帮助预防尿路感染。