头痛时做CT还是核磁共振（MRI），主要取决于医生的专业判断和你的具体情况。以下是一些可能的情况：

1. 一般性头痛：CT检查用于快速查看脑部结构，有较高的辐射暴露，但对脑组织的显示不如MRI清晰。如果只是为了排除急性脑部疾病，比如出血或者颅内压增高等，CT可能足够。

2. 疑似特定疾病：如肿瘤、炎症、血管病变等，MRI由于其对软组织的敏感性和高分辨率，可能更适合诊断这些问题。

3. 需要对软组织或神经结构有详细了解：MRI对软组织如脑组织、脊髓、神经等显示效果较好，适合这类检查。

综上，对于头痛患者，应根据具体症状、医生建议以及实际需求来决定做CT还是MRI。在某些情况下，可能需要先做CT筛查，然后根据结果决定是否需要做MRI。请在医生的指导下进行检查。