急性肾盂肾炎的主要并发症主要包括以下几点：

1. 慢性肾盂肾炎：如果急性肾盂肾炎未能得到彻底治愈，反复发作可能导致慢性肾盂肾炎，造成肾组织结构破坏，进一步可能发展为慢性肾功能不全。

2. 肾小球肾炎：有时急性肾盂肾炎可引起感染后肾小球肾炎，虽然这种情况相对较少见，但可能增加患慢性肾病的风险。

3. 败血症和多器官功能障碍：严重的感染可能引起全身炎症反应，引发败血症，进一步可能导致多器官功能障碍综合征(MODS)。

4. 泌尿系统结石：反复发生尿路感染可能导致结石形成，尤其是磷酸盐或草酸盐结石。

5. 耳、鼻、喉炎：尿路感染也可能影响邻近器官，比如发生中耳炎、鼻窦炎或扁桃体炎。

6. 尿路梗阻：若合并尿路结石、肿瘤、狭窄等梗阻因素，可能导致感染加重。

7. 肾组织破坏及纤维化：严重的感染可能引起肾小管或间质炎症，导致组织破坏和瘢痕形成，影响肾功能。

及时和正确的治疗是预防这些并发症的关键。