喉咙不舒服且呼吸困难可能是由多种原因导致的，以下是一些常见的可能原因：

1. 喉咙炎或扁桃体炎：细菌或病毒感染可能导致喉咙发炎，引起疼痛和呼吸困难，特别是吞咽时。

2. 支气管炎或肺炎：呼吸道感染可能导致炎症，使气道狭窄，呼吸困难。

3. 过敏反应：对某种物质如花粉、尘螨或宠物皮屑过敏，可能导致喉咙肿胀和呼吸困难。

4. 咽喉肿瘤：肿瘤可能导致局部堵塞，影响呼吸。

5. 哮喘或慢性阻塞性肺疾病：这两种疾病都可能导致气道狭窄，呼吸困难。

6. 呼吸道异物：如吞咽不慎将小物体吸入气管，也可能引起呼吸困难。

7. 睡眠相关呼吸暂停：以夜间频繁的呼吸暂停为特征，可能导致喉咙不适。

如果你出现这种症状，应尽快就医，尤其是如果伴随发热、咳嗽、体重减轻、疲劳或呼吸急促等症状，可能是因为严重疾病，需要及时处理。