月经过后第二天出现肚子疼的情况，可能有以下几种原因：

1. 生理期恢复：月经后，子宫内膜开始自我修复，这个过程可能会引起轻微的不适，包括轻微的腹部疼痛。这种情况通常会随着身体的恢复而减轻。

2. 宫缩：月经期间，子宫会收缩帮助排出血液，即使月经结束，子宫可能会继续收缩，尤其是在排出任何残留的血液或组织时，这可能导致疼痛。

3. 排卵痛（-Ovary Pain）：对于周期性排卵的女性，有时候排卵后可能出现一两天的轻度腹痛，这在月经周期中是正常现象。

4. 痛经后遗症：如果你平时有痛经，月经结束后的一两天内也可能会感到疼痛，这种现象通常称为”痛经后效应”。

5. 其他妇科疾病：如果疼痛持续存在或加重，可能是由子宫内膜异位症、子宫肌瘤、附件炎等妇科疾病引起的，应就医检查。

如果疼痛严重或持续不断，建议及时就医，以排除其他可能的疾病。同时，保持良好的生活习惯，如饮食均衡、适量运动、避免过度疲劳等也有助于缓解疼痛。