补牙后牙齿疼痛可能有以下几个原因：

1. 牙髓刺激：补牙过程中，牙医可能会对牙神经进行处理，如果操作不当或者治疗后牙神经暴露在空气和细菌中，可能会引起疼痛。这种疼痛通常在冷热刺激或者咬合时加重。

2. 创伤或炎症：补牙后，新的填充物可能会对牙龈产生一定的压力，导致短暂的疼痛。如果在补牙过程中牙龈被切割或损伤，也可能会出现疼痛。

3. 药物反应：一些用于牙齿麻醉的局部麻醉药物可能会引起短暂的针扎性疼痛，一般在药效消退后会自行消失。

4. 填充物不适合：如果补牙的填充物与牙齿不匹配，或者安装得不够紧密，可能会引起持续的疼痛。

5. 感染：如果在补牙过程中或补牙后存在感染，可能会出现持续的疼痛，甚至可能会有肿胀和发热的症状。

如果补牙后的疼痛持续超过24小时，且伴随红肿、发热、流脓等症状，应该立即联系牙医进行检查，可能需要对症处理或重新检查补牙情况。