瑞舒伐他汀和阿托伐他汀都是常用的胆固醇降低药物，属于他汀类药物，用于治疗高胆固醇血症、混合型高脂血症以及心血管疾病的预防。它们的主要区别在于：

1. 化学结构和代谢：瑞舒伐他汀（Rosuvastatin）是一种选择性胆固醇吸收抑制剂，主要通过抑制HMG-CoA还原酶（胆固醇合成的关键酶）发挥作用。它与肝细胞中的一型CYP3A4酶高度亲和，代谢后主要产物是结晶紫酮酸（Rosuvastatin acid），半衰期较阿托伐他汀长，一般为12-14小时。

2. 剂量和效能：相同剂量下，瑞舒伐他汀的降胆固醇效果可能略强于阿托伐他汀。研究表明，瑞舒伐他汀可能需要更低的剂量就可以达到相似的低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）降低效果。

3. 药物相互作用：由于瑞舒伐他汀对CYP3A4的高亲和力，它可能会增加与3A4酶代谢药物的相互作用。例如，与伊曲康唑、克拉霉素等药物合用可能增加瑞舒伐他汀的血药浓度，导致副作用。而阿托伐他汀对CYP3A4的影响较小。

4. 不良反应：两药都可能引起肌肉疼痛、横纹肌溶解症等副作用，但瑞舒伐他汀的肌肉副作用有文献报道可能更少些。具体的反应个体差异大，应在医生指导下用药。

总的来说，瑞舒伐他汀和阿托伐他汀都有其特性和优缺点，选择哪种药物取决于患者的具体情况和医生的建议。普通情况下，定期监测血脂水平和定期看医生是最重要的。