药物治疗睡眠障碍通常包括使用镇静催眠药、抗抑郁药、抗焦虑药以及一些用于改善睡眠周期的药物。这些药物可能会产生以下副作用：

1. 嗜睡和昏昏欲睡：可能导致晨起困难，特别是在开始使用药物的几天内。
2. 头晕或眩晕：这是常见副作用，尤其是在用药后立即活动。
3. 干涩的嘴巴：某些药物可能会引起口腔黏膜干燥。
4. 反胃或消化不适：部分患者可能会感到胃部不适或恶心。
5. 体重增加：一些抗抑郁药和催眠药可能导致体重增加。
6. 短期记忆力减退或思维迟钝：长期大量服用可能会影响认知功能。
7. 依赖性和戒断症状：某些催眠药可能会让人产生药物依赖性，突然停止使用可能会出现戒断反应。
8. 错误记忆或梦境形式混淆：这种副作用导致梦境和现实之间的界限模糊。
9. 可能影响其他药物的作用：同时使用某些药物可能会影响药物的代谢或效果。

每个人对药物的反应不同，副作用也可能因人而异。在开始使用这些药物治疗睡眠障碍之前，应详细讨论潜在的风险和益处，并在医生的指导下进行。如果出现严重或持续的副作用，应及时与医生联系。