前列腺炎是一种常见的男性泌尿系统感染，通常由细菌感染引起。虽然药物治疗可以帮助缓解前列腺炎的症状，但是疼痛可能仍然存在，这可能是由于以下原因：

1. 感染严重：前列腺炎可能由多种细菌引起，其中一些可能对药物产生抗性。如果感染严重，药物可能无法完全消除感染，导致疼痛持续存在。

2. 药物副作用：某些用于治疗前列腺炎的药物可能导致疼痛或不适。这些副作用可能是暂时的，也可能持续存在。

3. 炎症扩散：前列腺炎可能扩散到周围的组织和器官，导致疼痛。

4. 个人差异：每个人对疼痛的敏感度和反应可能不同，这可能导致药物治疗无法完全消除疼痛。

治疗前列腺炎的药物包括抗生素和抗炎药物。如果疼痛持续存在，建议咨询医生，了解可能的治疗选择和进一步的检查。此外，保持良好的生活习惯，如饮食健康、避免过度饮酒和吸烟，也有助于缓解前列腺炎的症状。