耳朵根部长疙瘩并伴有疼痛可能是耳部感染或耳部炎症的表现。以下是一些可能的原因和建议：

1. 外耳炎：外耳炎是一种常见的耳部感染，通常由细菌感染引起。症状包括耳朵红肿、疼痛和瘙痒。建议您及时就医，医生可能会建议使用抗生素治疗。

2. 耳道异物：耳道异物可能引起耳朵红肿、疼痛和瘙痒。建议您及时就医，医生可能会建议使用耳道冲洗器或手术取出异物。

3. 耳部过敏：耳部过敏可能引起耳朵红肿、疼痛和瘙痒。建议您避免接触过敏原，如花粉、灰尘等。如果症状严重，建议您就医。

4. 耳部损伤：耳部损伤可能引起耳朵红肿、疼痛和瘙痒。建议您避免碰撞或撞击耳朵，并尽快就医。

建议您及时就医，以便医生能够进行详细的检查和诊断。在就医期间，尽量保持耳朵干燥，避免使用耳塞或耳棉球，以免引起感染。