月经不调的鉴别诊断依据主要包括以下几个方面：

1. 病史：了解患者的月经初潮年龄、月经周期、经期长度、经量、经期疼痛、经前症状（如乳房胀痛、情绪波动等）、生育史、家族史等。

2. 体格检查：包括测量身高、体重、血压、测量子宫、卵巢大小、触诊子宫位置、附件包块等。

3. 妇科检查：包括阴道检查、宫颈刮片检查、子宫内膜活检等。

4. 激素检测：包括性激素六项（FSH、LH、E2、P、T、PRL）、黄体生成素（LHCG）、孕激素（PRL）等。

5. 影像学检查：包括B超、MRI等。

6. 功能检查：如甲状腺功能、糖尿病等。

综合以上信息，医生可以综合分析，鉴别诊断月经不调的可能原因，如子宫内膜异位症、子宫肌瘤、卵巢功能减退、多囊卵巢综合征、子宫内膜息肉、子宫颈癌等。