输尿管结石碎石后仍然感到疼痛可能是因为以下几个原因：

1. 残留结石：碎石手术可能会留下一些较小的结石碎片，这些碎片可能会引起疼痛。如果碎石手术没有完全清除结石，残留的结石可能会刺激输尿管壁，导致疼痛。

2. 输尿管痉挛：碎石手术可能会引起输尿管的痉挛，导致输尿管狭窄，从而引起疼痛。

3. 感染：碎石手术可能会导致输尿管的感染，这可能会引起疼痛。

4. 术后疼痛反应：每个人对疼痛的敏感度不同，有些人可能会对碎石手术后的疼痛产生反应。

如果你在碎石手术后仍然感到疼痛，建议你尽快就医，向医生详细描述你的症状，以便医生能够进行进一步的检查和治疗。

此外，碎石手术后，保持良好的饮食和生活习惯，多喝水，避免过度劳累和剧烈运动，有助于减轻疼痛和促进康复。