杭州最好的不孕不育医院可能因个体差异而有所不同。以下是一些杭州知名的不孕不育医院，供您参考：

1. 杭州市妇产科医院：杭州市妇产科医院是浙江省妇产科专科医院，也是杭州市妇幼保健院，拥有先进的医疗设备和专业的医护团队，提供不孕不育治疗、检查和咨询服务。

2. 杭州市红十字会医院：杭州市红十字会医院是杭州市妇幼保健院，也是浙江省妇幼保健院，拥有先进的医疗设备和专业的医护团队，提供不孕不育治疗、检查和咨询服务。

3. 杭州市一医院：杭州市一医院是浙江省妇幼保健院，也是杭州市妇幼保健院，拥有先进的医疗设备和专业的医护团队，提供不孕不育治疗、检查和咨询服务。

4. 杭州市西溪医院：杭州市西溪医院是浙江省妇幼保健院，也是杭州市妇幼保健院，拥有先进的医疗设备和专业的医护团队，提供不孕不育治疗、检查和咨询服务。

在选择医院时，建议您先了解医院的医疗资质、专业水平、医疗设备、医护团队等方面的情况，再根据个人需求和预算做出选择。同时，建议您咨询专业医生或医疗机构，获取更详细的信息和建议。