怀孕三个月停胎的原因可能是多种多样的，以下是一些可能的原因：

1. 遗传问题：某些遗传疾病可能会导致怀孕早期停胎。这些疾病可能与胚胎发育过程中的基因异常有关。

2. 子宫异常：子宫结构异常或子宫内膜异常可能导致怀孕早期停胎。这些问题可能与子宫内膜发育不良、子宫结构畸形或子宫内膜异位症有关。

3. 妊娠并发症：妊娠并发症也可能导致怀孕早期停胎。这些并发症包括胎盘早剥、妊娠期高血压疾病、子宫肌瘤破裂等。

4. 感染：怀孕早期停胎也可能与感染有关。这些感染可能包括病毒感染（如风疹病毒、巨细胞病毒）、细菌感染（如淋病、梅毒）或寄生虫感染（如弓形虫病）。

5. 药物或化学物质：某些药物或化学物质可能会导致怀孕早期停胎。这些物质可能包括处方药物、非处方药物、农药、化学品等。

6. 环境因素：某些环境因素也可能导致怀孕早期停胎。这些因素可能包括放射线、化学物质暴露、重金属污染等。

这些原因只是可能的原因之一，具体的原因可能因个体而异。如果您担心怀孕早期停胎的原因，建议您咨询专业医生或妇产科医生，他们可以对您的具体情况进行评估和诊断。