跑步两天腿疼可能是由于肌肉疲劳、运动损伤或者其他健康问题引起的。在这种情况下，是否继续跑步取决于疼痛的程度和原因。

首先，如果你的疼痛是由于运动损伤引起的，例如肌肉拉伤或扭伤，建议你立即停止跑步，给受伤的部位充分的休息和恢复时间。在恢复期间，你可以进行一些轻度的康复训练，例如伸展运动和肌肉放松练习，以帮助恢复和预防进一步的损伤。

如果你的疼痛是由于肌肉疲劳引起的，这可能是由于长时间的跑步或高强度的训练导致的。在这种情况下，你可以尝试减少跑步的强度和频率，给肌肉充分的休息时间。同时，你也可以尝试进行一些轻度的肌肉放松练习，例如按摩和拉伸，以帮助缓解肌肉疲劳。

如果你的疼痛是由于其他健康问题引起的，例如关节炎或骨质疏松症，建议你咨询专业医生的意见，以确定是否继续跑步。

总之，跑步两天腿疼可能是由于多种原因引起的，建议你根据疼痛的程度和原因，咨询专业医生的意见，以确定是否继续跑步。在恢复期间，你可以采取一些轻度的康复训练和肌肉放松练习，以帮助恢复和预防进一步的损伤。