怀孕初期孕酮低可能是由于多种原因引起的。以下是一些可能的原因：

1. 黄体功能不足：黄体功能不足是指黄体分泌的孕酮不足，这可能是由于黄体发育不良、黄体功能不全或黄体功能过早衰退导致的。

2. 黄体功能不足的遗传因素：一些遗传因素可能导致黄体功能不足，例如黄体生成素受体（LHRH）基因突变、黄体生成素受体基因突变等。

3. 黄体功能不足的内分泌疾病：一些内分泌疾病可能导致黄体功能不足，例如多囊卵巢综合症（PCOS）、高泌乳素血症（HPRL）、垂体功能减退症等。

4. 药物或环境因素：某些药物（如避孕药、抗生素等）或环境因素（如化学品、放射线等）可能影响黄体功能，导致孕酮低。

5. 其他疾病：一些其他疾病也可能导致孕酮低，例如子宫内膜异位症、子宫肌瘤、子宫内膜息肉等。

如果你怀疑自己怀孕初期孕酮低，建议咨询医生进行进一步的检查和诊断。医生可能会进行黄体功能检查、内分泌检查、超声检查等，以确定具体的病因。