跑步后小腿肚子疼可能是由于以下几种原因引起的：

1. 肌肉拉伤：跑步时，小腿肌肉长时间处于紧张状态，如果肌肉没有得到充分的休息和恢复，就可能导致肌肉拉伤。这种情况通常伴随着疼痛、肿胀和僵硬感。

2. 运动损伤：跑步时，如果跑步姿势不正确或者地面不平整，可能会导致小腿肌肉、韧带和关节的损伤。这种情况通常伴随着疼痛、肿胀和功能障碍。

3. 运动过量：跑步时，如果跑步强度过大或者跑步时间过长，可能会导致肌肉疲劳和炎症。这种情况通常伴随着疼痛、疲劳和肌肉僵硬感。

4. 骨质疏松：跑步时，如果跑步强度过大或者跑步时间过长，可能会导致骨质疏松。这种情况通常伴随着疼痛、骨折和骨骼变形。

如果你感到小腿肚子疼，建议你先休息一段时间，给肌肉充分的休息和恢复时间。如果疼痛持续或加重，建议你去看医生，进行进一步的检查和治疗。此外，在跑步时，建议你选择合适的跑步鞋，保持正确的跑步姿势，避免跑步时地面不平整的情况。