主动脉瓣窦动脉瘤的形成，一旦发展并逐渐扩大，最终必然导致瘤体破裂。因此，对于被确诊为主动脉瓣窦动脉瘤的患者，无论是否发生破裂，都应该考虑进行主动脉瓣窦动脉瘤切除手术。对于急性破裂的患者，在经过内科治疗改善心力衰竭后，应尽早施行手术治疗。如果心力衰竭无法控制，更需要在早期进行手术。

手术过程采用体外循环结合低温和心肌保护。患者取仰卧位，通过胸骨正中的纵向切口，在切开胸骨后切开心包，可以在破裂的动脉瘤进入心脏表面时触及明显的震颤感。在必要时，可以进行心内探查。

心脏切口途径根据主动脉瓣窦动脉瘤破入腔室部位或伴发心脏畸形来确定，可以选择右房、右室或主动脉切口。切开心脏后，暴露出瘤体，其形状呈风兜状，壁薄而光滑，顶部可能有一个或多个破口。破裂的动脉瘤有内外两个口，内口位于主动脉瓣窦处。在纵向剪开瘤壁后，距内口约0.3～0.4cm处再环形剪除整个囊壁，保留内口周围较坚韧的囊壁组织以便进行缝合。缝合时首先进行“8”字连续缝合，然后再通过垫褥式缝合来加固缝线。

通过主动脉切口途径，可以直接从冠状动脉口注入停搏液，并且可以精确检视瓣叶。对于窦状动脉瘤，可以从右房或右室引导至主动脉内，切除多余的瘤壁。窦瘤的切除和缝合方法与上述相一致。对于合并的嵴上型室间隔缺损，可以通过主动脉切口或右心室切口进行修补。如果伴随有主动脉瓣关闭不全，还可以同时进行主动脉瓣成形术或主动脉瓣膜置换术。