肚子疼在跑步时出现可能是由于多种原因引起的。以下是一些可能的原因：

1. 消化问题：跑步时，胃部的蠕动可能会增加，导致消化不良。这可能会引起肚子疼。消化问题包括胃酸过多、胃溃疡、十二指肠溃疡等。

2. 运动伤害：跑步时，如果跑步姿势不正确，或者跑步时的步幅过大，可能会导致腹肌、腹壁肌肉和骨盆底肌肉的过度拉伸，从而引起肚子疼。

3. 肌肉痉挛：跑步时，腹肌、腹壁肌肉和骨盆底肌肉可能会因为长时间的收缩而发生痉挛。这种痉挛可能会引起肚子疼。

4. 运动过度：如果你跑步时的运动量过大，超过了身体能够承受的范围，可能会导致肌肉疲劳和肌肉痉挛，从而引起肚子疼。

5. 其他疾病：一些其他疾病也可能导致跑步时肚子疼，例如肠痉挛、肠梗阻、肠扭转、阑尾炎等。

如果你经常跑步，并且遇到肚子疼的情况，建议你去看医生，进行详细的身体检查。医生可以通过详细的病史、体格检查和必要的实验室检查，来确定肚子疼的具体原因，并给出相应的治疗建议。