来月经时肚子疼和腰疼可能是由于多种因素引起的。以下是一些可能的原因：

1. 子宫收缩：月经期间，子宫会收缩以排出子宫内膜和血液。这种收缩可能会引起子宫肌肉的疼痛，尤其是在月经来的第一天。

2. 子宫内膜异位症：这种疾病会导致子宫内膜在子宫外生长，可能会引起子宫内膜异位症相关的疼痛，包括肚子疼和腰疼。

3. 子宫肌瘤：子宫肌瘤是一种常见的子宫内膜异位症，它们可能会引起子宫肌肉的疼痛，包括肚子疼和腰疼。

4. 子宫内膜异位症相关的盆腔疼痛综合征（PIDS）：这是一种慢性疾病，可能导致盆腔疼痛、肚子疼和腰疼。

5. 盆腔炎：盆腔炎是一种感染性疾病，可能导致盆腔疼痛、肚子疼和腰疼。

如果你的肚子疼和腰疼在月经期间出现，建议咨询医生进行进一步的检查和诊断。医生可能会进行妇科检查、血液检查和可能的影像学检查（如B超），以确定具体的原因。

如果你的疼痛严重或持续时间较长，建议尽快就医。医生可能会根据你的具体情况制定治疗方案，包括药物治疗、手术治疗或生活方式改变。