舌下神经损伤的预后在于受损的位置、病因和程度，这导致了不同的结果。

双侧核上性瘫痪、两侧舌下神经核造成的双侧弛缓性瘫痪、以及两侧周围性舌下神经麻痹引发的舌肌完全瘫痪，都会因为言语和吞咽方面的严重障碍而显著影响患者的生活质量。治疗的重点包括处理颅内原发疾病以及采取对症治疗措施，例如鼻饲流质、静脉补液、预防感染，甚至在必要时进行气管切开。这是因为可能发生并发的顽固性吸入性肺炎和进食困难，导致患者出现营养不良、衰竭甚至死亡。舌下神经的功能恢复需要进行神经重建。

相比之下，一侧核上性损伤引起的舌瘫可能伴随一些呐吃的症状，但并不会导致吞咽困难，对患者的生活质量影响较轻。单侧性周围性舌下神经麻痹在生存方面影响较小，尽管舌下神经的恢复程度有限，但部分患侧舌肌瘫痪可能是可改善的。