肛瘘是一种常见的肛肠疾病，检查肛瘘的方法主要包括以下几种：

1. 直肠指检：这是一种最常见的肛肠检查方法，医生用一根手指伸入患者的直肠内，检查肛瘘的位置、大小和数量。

2. 内窥镜检查：包括结肠镜和直肠镜。结肠镜用于检查结肠，直肠镜用于检查直肠。这些检查方法可以直接观察肛瘘的位置和大小。

3. X光检查：包括直肠X光检查和钡灌肠。直肠X光检查可以观察肛瘘的位置和大小，而钡灌肠可以观察直肠和肛瘘的形态。

4. 肛门直肠压力测定：这种检查方法可以测量肛门和直肠内的压力，有助于判断肛瘘的位置和大小。

5. 肛周皮肤活检：通过在肛周皮肤上取一小块组织进行病理检查，可以确定肛瘘的类型和严重程度。

在进行检查之前，医生可能会要求患者进行一些准备，例如清空肠道，以避免检查时的不适。在进行检查时，患者可能会感到不适，但检查过程通常是短暂的，并且医生会尽力减轻患者的不适感。