妊娠合并甲亢的病因主要包括以下几个方面：

1. 自身免疫因素：甲状腺自身免疫反应是妊娠合并甲亢的主要病因之一。这种自身免疫反应可能与遗传、环境因素、感染等因素有关。

2. 药物因素：某些药物可能导致甲状腺功能亢进，如利巴韦林、锂盐、苯妥英等。这些药物在妊娠期间使用可能会增加妊娠合并甲亢的风险。

3. 遗传因素：某些基因突变可能导致甲状腺功能亢进，如甲状腺过氧化物酶（TPO）基因突变、甲状腺过氧化物酶受体（TR）基因突变等。这些基因突变可能与妊娠合并甲亢的发生有关。

4. 环境因素：某些环境因素可能增加妊娠合并甲亢的风险，如接触放射线、接触某些化学物质等。

5. 其他因素：妊娠合并甲亢还可能与一些其他因素有关，如甲状腺结节、甲状腺手术等。

总的来说，妊娠合并甲亢的病因是多方面的，包括自身免疫、药物、遗传、环境等多种因素。这些因素可能相互作用，导致妊娠合并甲亢的发生。