再生障碍性贫血、肝炎、白血病、贫血、以及骨髓造血功能衰竭的机制涉及三个主要理论：原发性或继发性造血干细胞数量和/或质的异常（“种子”理论）、造血微环境异常（土壤理论）以及免疫异常（虫子理论）。然而，实际上，大多数观点认为再障实质上是由不同病因共同引起的造血调控失衡的结果。

目前，公认与后天获得性再障相关的危险因素包括药物、化学物质、电离辐射和病毒感染等。

1. 电离辐射

X射线、γ射线以及放射性同位素进入细胞，影响具有重要生物作用的大分子，破坏DNA和蛋白质，从而可能导致所有细胞的电离辐射损伤。在这其中，骨髓细胞中红细胞最为敏感，其次是粒细胞，再次为巨核细胞系。

2. 病毒感染

各种类型的病毒，包括再生障碍性贫血、肝炎、白血病、贫血病毒、EB病毒、风疹病毒、带状疱疹病毒、登革热病毒、流感病毒、人类免疫缺陷病毒以及人类T淋巴细胞再生障碍性贫血、肝炎、白血病、贫血病毒等，都有可能对骨髓造血造成损害，引发再生障碍性贫血、肝炎、白血病、贫血或骨髓造血受抑的症状。

3. 药物和化学物质

药物和化学物质是引起再障最常见的危险因素。药物诱发再障的发病率目前仍然难以确定。其中，氯霉素和保泰松是与再障关系报道最为密切的药物。