肚子疼在同房的时候出现可能有多种原因。以下是一些可能的解释：

1. 生理原因：同房时，子宫和肠道的肌肉可能会收缩，导致轻微的疼痛。这种疼痛通常是短暂的，不会持续很长时间。

2. 盆腔炎症：盆腔炎症可能导致同房时的疼痛。盆腔炎症是一种常见的妇科疾病，可能由细菌感染引起。如果疼痛持续存在，建议咨询医生进行检查。

3. 子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是一种妇科疾病，其中子宫内膜组织生长在子宫外，如卵巢、盆腔等部位。同房时，这些异位的子宫内膜组织可能会刺激子宫，导致疼痛。

4. 子宫肌瘤：子宫肌瘤是一种常见的妇科疾病，表现为子宫内膜的异常生长。同房时，子宫肌瘤可能会刺激子宫，导致疼痛。

5. 子宫内膜异位囊肿：子宫内膜异位囊肿是一种子宫内膜异位症的并发症，表现为子宫内膜异位到子宫肌层形成囊肿。同房时，这些囊肿可能会刺激子宫，导致疼痛。

如果你在同房时感到持续的疼痛或不适，建议咨询医生进行检查。医生可以通过详细的病史、体格检查和可能的辅助检查（如妇科超声、盆腔CT等）来确定疼痛的具体原因。