肛瘘手术后，可能会出现一些后遗症，具体取决于手术的具体情况和个体差异。以下是一些可能出现的后遗症：

1. 疼痛：手术后可能会出现疼痛，这可能是由于手术切口、伤口愈合和瘘管闭合引起的。疼痛可能会持续一段时间，但通常会逐渐减轻。

2. 感染：手术后可能会出现感染，这可能是由于手术切口或瘘管愈合不良引起的。感染的症状可能包括发热、红肿、疼痛和分泌物增多。

3. 瘘管复发：手术后，瘘管可能会复发，这可能是由于手术切口愈合不良或手术操作不当引起的。复发的瘘管可能会导致疼痛、分泌物增多和感染。

4. 排便困难：手术后可能会出现排便困难，这可能是由于手术切口愈合和瘘管闭合引起的。排便困难可能会持续一段时间，但通常会逐渐改善。

5. 伤口愈合不良：手术后，伤口愈合可能会出现问题，这可能是由于手术操作不当、切口感染或手术切口愈合不良引起的。伤口愈合不良可能会导致伤口疼痛、红肿和分泌物增多。

6. 伤口疼痛：手术后，伤口可能会出现疼痛，这可能是由于手术切口愈合和瘘管闭合引起的。伤口疼痛可能会持续一段时间，但通常会逐渐减轻。

需要提醒的是，每个人的情况可能会有所不同，因此具体的后遗症可能会因人而异。手术后，建议患者按照医生的建议进行康复治疗和护理，以促进伤口愈合和恢复。