卵巢囊肿的诊断鉴别可以从以下几个方面进行：

1. 病史：如果患者有长期腹痛、阴道出血、月经异常等症状，那么这些都是卵巢囊肿的典型表现。此外，患者还可能会有一些其他的症状，如性生活疼痛、尿频、尿急等。

2. 体征：在进行检查时，医生通常会观察患者的体征，如触摸卵巢时是否有明显的触痛感觉、是否有异常的压痛等。

3. 影像学检查：通过CT、MRI等影像学检查可以更加准确地观察卵巢内部情况。这些检查可以帮助医生了解卵巢内部结构和病变情况。

4. 实验室检查：一些常见的卵巢囊肿会伴随着血液中的蛋白质含量增高，这也是诊断卵巢囊肿的重要指标之一。

5. 药物治疗：对于某些卵巢囊肿，药物治疗也是非常有效的。例如抗生素类药物可以帮助控制感染和炎症反应，而激素类药物则可以调节卵巢内部激素水平。

总之，在进行诊断时需要综合考虑多种因素，并根据具体情况选择最合适的方法和手段进行治疗。