同房的时候肚子疼可能是由多种原因引起的，具体情况可能因人而异。以下是一些可能的原因：

1. 生理原因：同房时，子宫和肠道的肌肉可能会因为收缩而引起轻微的疼痛。这种疼痛通常不会持续很长时间，而且不会影响到性生活的进行。

2. 妇科疾病：一些妇科疾病，如子宫内膜异位症、子宫肌瘤、子宫颈癌等，可能会导致同房时的疼痛。这些疾病通常需要专业的医疗诊断和治疗。

3. 性传播感染：某些性传播感染，如淋病、衣原体感染等，可能会引起同房时的疼痛。这些感染通常需要专业的医疗诊断和治疗。

4. 子宫痉挛：子宫痉挛是一种罕见的妇科疾病，通常发生在月经期间。在痉挛发作时，子宫肌肉会收缩，导致疼痛和痉挛。这种疼痛通常会在几分钟内消失。

5. 其他原因：一些其他的原因也可能导致同房时的疼痛，如子宫内膜异位症、盆腔炎症等。这些原因通常需要专业的医疗诊断和治疗。

如果你在同房时感到持续的、严重的疼痛，建议你尽快咨询专业医生。他们可以通过详细的病史、体格检查和必要的实验室检查，来确定疼痛的具体原因，并给出相应的治疗建议。