以下是儿童矮小症的发病原因的一些常见解释：

1. 遗传因素：某些基因突变可能导致儿童身材矮小。这些基因可能影响生长激素的分泌、骨密度和骨龄等。

2. 内分泌问题：生长激素分泌不足或生长激素受体缺陷可能导致儿童身材矮小。此外，甲状腺功能异常（如甲状腺功能减退症）也可能导致身材矮小。

3. 营养不良：儿童长期营养不良可能导致生长发育迟缓，进而导致身材矮小。

4. 慢性疾病：某些慢性疾病，如慢性肾病、糖尿病等，可能影响儿童的身高发育。

5. 环境因素：某些环境因素，如长期暴露于重金属、农药等化学物质，可能影响儿童的身高发育。

6. 心理因素：儿童的心理压力、焦虑等可能影响生长激素的分泌，进而影响身高发育。

需要注意的是，这些发病原因可能相互影响，导致儿童身材矮小的原因可能是多种因素的综合。因此，在诊断和治疗儿童矮小症时，医生通常会综合考虑患者的病史、体格检查、实验室检查等，以确定具体的发病原因。