功能性卵巢囊肿是一种常见的妇科疾病，治疗方法取决于囊肿的大小、数量、症状的严重程度以及患者的年龄和生育要求。以下是一些常见的治疗方法：

1. 观察和监测：对于小的囊肿，医生可能会建议观察和定期监测囊肿的大小和变化。

2. 药物治疗：一些药物，如孕激素和黄体酮，可以帮助缩小囊肿。

3. 手术治疗：对于较大的囊肿或囊肿引起的症状，手术可能是必要的。手术可以包括囊肿剥除术或卵巢切除术。

4. 辅助生殖技术：对于希望保留卵巢的女性，可以考虑使用辅助生殖技术，如体外受精-胚胎移植（IVF-ET）。

治疗选择应该由专业医生根据患者的具体情况做出。建议患者咨询专业医生，了解治疗方案的利弊，并制定个性化的治疗计划。