难治性便秘是一种常见的消化系统疾病，以下是一些常见的检查方法：

1. 体格检查：医生会检查患者的腹部，包括肛门，以确定是否有硬结、疼痛或不适。

2. 直肠指检：医生将一根手指插入患者的肛门，以检查直肠和肛门周围的情况，如是否有硬结、炎症或肿瘤。

3. 粪便分析：医生会收集患者的粪便样本，进行分析，以确定粪便中是否存在异常的细胞、细菌或病毒。

4. 结肠镜检查：医生通过一根细长的管道，插入患者的肛门，通过观察结肠内壁的情况，以确定是否有炎症、溃疡、息肉或肿瘤。

5. 磁共振成像（MRI）：MRI是一种非侵入性的成像技术，可以提供详细的结肠和直肠结构图像，以确定是否有炎症、肿瘤或狭窄。

6. 血液检查：医生可能会检查患者的血液样本，以确定是否存在贫血、炎症或电解质紊乱等。

7. 心理评估：便秘可能与心理因素有关，医生可能会进行心理评估，以确定是否存在焦虑、抑郁或其他心理问题。

这些检查方法可以帮助医生确定便秘的原因，并制定相应的治疗计划。