一旦确立诊断，应制订科学合理的全面治疗计划。在疾病急性期，首要任务是采取有力措施，迅速减轻患者的痛苦，缓解症状，有效控制发作。在急性发作期的症状控制达到康复后，应进行长期治疗，旨在防止病情复发，改善预后。

对于抑郁症的治疗方法包括药物治疗、心理治疗和物理治疗。

药物治疗具有起效迅速、疗效确定的特点，适用于中度至重度抑郁症患者。目前，抗抑郁药物是治疗各种抑郁障碍的主要药物，其有效解除抑郁心境及伴随的焦虑、紧张和躯体症状的效果约为60%至80%。

常用的抗抑郁药包括SSRI类药物（如帕罗西汀、舍曲林、氟西汀、西酞普兰、氟伏沙明等），SNRI类药物（如文拉法辛、度洛西汀），NaSSAs类药物（如米氮平），安非他酮等。对于一些伴有焦虑和睡眠障碍的患者，还可以短期使用苯二氮卓类药物或者新型助眠药物。对于症状较为严重、甚至伴有精神病性症状的患者，可以考虑合并抗精神病药物治疗。

心理治疗适用于急性期无消极观念的轻中度抑郁症，以及各类抑郁症急性期症状控制后的巩固和维持治疗。心理治疗要求患者具备一定的理解和领悟能力，能够坚持治疗并在一定程度上忍受治疗过程中的不适。虽然并非所有患者都适合心理治疗，但坚持进行心理治疗有助于提高心理健康水平和社会适应能力，有效预防抑郁症的复发。

物理治疗包括改良电休克治疗（MECT）和重复经颅磁刺激治疗（rTMS）。对于有严重自杀倾向、抑郁性木僵患者，MECT治疗是首选。MECT治疗见效快，疗效显著，但常伴有短期内记忆力减退、头痛、恶心等副作用。rTMS治疗是一种新型的物理治疗方式，适用于难治性抑郁患者。在药物治疗的同时，rTMS可以作为一种有效的补充治疗，但接受过MECT治疗的患者需在停用MECT后至少一个月方可尝试rTMS治疗。