怀孕三个月的腰疼可能是由于子宫的增大和重量的增加，对腰部肌肉和韧带造成了一定的压力和拉伸。这种疼痛可能是由子宫韧带松弛、腰肌劳损或骨盆倾斜等原因引起的。以下是一些可能导致腰疼的原因和建议：

1. 子宫韧带松弛：怀孕期间，子宫韧带会松弛以适应子宫的增大。这可能会导致腰部肌肉和韧带的拉伸，从而引起疼痛。建议采取一些缓解措施，如保持良好的姿势，避免长时间保持同一姿势，进行适当的伸展运动，如骨盆前倾和后倾的伸展运动。

2. 腰肌劳损：怀孕期间，腰部肌肉承受了额外的压力，尤其是在站立和行走时。这可能导致腰肌劳损，引起疼痛。建议采取一些缓解措施，如保持良好的姿势，避免长时间保持同一姿势，进行适当的伸展运动，如腰部的伸展运动。

3. 骨盆倾斜：怀孕期间，骨盆可能会倾斜，以适应子宫的增大。这可能导致腰部肌肉和韧带的拉伸，引起疼痛。建议采取一些缓解措施，如保持良好的姿势，避免长时间保持同一姿势，进行适当的伸展运动，如骨盆前倾和后倾的伸展运动。

4. 其他原因：其他可能的原因包括子宫内膜异位症、子宫肌瘤、腰椎间盘突出等。如果腰疼持续存在或加重，建议咨询医生进行进一步的检查和诊断。

总之，怀孕三个月的腰疼可能是由于子宫的增大和重量的增加引起的。采取适当的缓解措施，如保持良好的姿势、进行适当的伸展运动，可以缓解疼痛。如果腰疼持续存在或加重，建议咨询医生进行进一步的检查和诊断。