小儿肛瘘是一种较为罕见的肛肠疾病，其原因可能包括以下几种：

1. 先天缺陷：一些小儿可能由于先天性肛门直肠畸形、肛门直肠狭窄、肛门直肠裂等缺陷，导致肛瘘的发生。

2. 感染：小儿的免疫系统尚未完全发育，容易受到感染，如肛周感染、肛窦炎等，这些感染可能导致肛瘘的发生。

3. 外伤：小儿在玩耍、运动或意外事故中，可能导致肛门直肠损伤，进而引发肛瘘。

4. 手术：小儿在肛肠手术中，如直肠肛管成形术、直肠肛管切除术等，也可能引发肛瘘。

5. 其他原因：一些小儿可能由于其他原因，如肛周脓肿、肛周肿瘤等，引发肛瘘。

需要注意的是，小儿肛瘘的具体原因可能因个体差异而有所不同，因此具体的诊断和治疗方案应该由专业的儿科医生进行评估和制定。