男性免疫性不育是指男性体内发生自身免疫反应，导致对精子、精浆、女性卵子、生殖道分泌物和激素等产生抗体物质，从而影响精子的活力或卵泡的成熟和排卵。有研究表明，约有5%～9%的不育男性体内存在抗精子抗体，可能是由于双侧输精管阻塞或结扎，或曾经患有严重的生殖道感染。

局部免疫则是指一些不孕妇女的子宫颈粘膜和子宫内膜含有产生免疫球蛋白和淋巴样细胞的情况。子宫颈粘液中含有抗精子的免疫球蛋白和M，因此子宫颈和女性生殖道对精子具有局部免疫作用。

同种免疫是指男方的精子和精浆作为抗原，进入女方体内产生抗体，导致精子凝集或失去活动力。一般情况下，女性并不产生免疫反应，只有约15%～18%的不孕妇女体内存在抗精子抗体。在女性经期或患有子宫内膜炎等疾患时，子宫内膜受损或发生肛门性交，精子及其抗原物质易于进入血流，激发女性的免疫反应。细胞免疫因素也与男性不育症有关，一些不育者的精液中白细胞增多，这可能会影响精子运动，使精子活力降低，形态发生改变。

女性体内的抗性腺激素抗体和抗性腺激素受体的抗体可能导致卵巢早衰和卵巢性闭经。月经周期中，子宫内膜异位症产生分解物，由巨噬细胞系统清除，但刺激抗体产生，引发自身免疫反应。